Nel 1631, con l'estinzione della dinastia dei Della Rovere, Ducato e Vicariato di Mondavio ritornano nella giurisdizione della Santa Sede. Pur mantenendo la sua autonomia, l’ex Ducato di Urbino entra nello Stato della Chiesa con lo status di Legazione, sotto il governo del legato, affidato a un cardinale. Il primo dei trentasette legati cardinali, succedutisi dal 1631 al 1797, è il cardinale Antonio Barberini, nipote di Urbano VIII. È noto che anche dopo la devoluzione rimane in vigore la legislazione roveresca. Con la venuta di Napoleone Bonaparte tutto invece viene cambiato.